Унікальні хімічні властивості перекису водню, а також його екологічна чистота зумовлює широке застосування цієї хімічної речовини у різноманітних екологічних технологіях. Існує цілий ряд прикладів, де перекис водню допомагає запобігати або зменшувати негативний вплив на довкілля.

Процес ефективного окислення одна з найголовніших технологій з обробки стічних вод. У цій технології застосовується високий окисний потенціал гідроксильних радикалів, найсильнішого з відомих окислювачів, для розкладання токсичних речовин на продукти, що легко розкладаються в наступних біологічних процесах.

Перекис водню, основним компонентом процесу ефективного окислення, є джерелом гідроксильних радикалів. Процес ефективного окислення успішно застосовується для обробки різних відпрацьованих вод від нафтопереробних, хімічних чи фармацевтичних підприємств, і навіть стічних вод населених пунктів.

У сталеливарній промисловості, яка, наприклад, використовує азотну кислоту для травлення, може бути значно скорочений обсяг викидів двоокису азоту та закису азоту в результаті використання перекису водню.

Він також використовується для ослаблення токсичності та запаху на паперових фабриках, заводах з переробки відходів, сталеплавильних печей, у фармацевтичному, хімічному, нафтохімічному виробництві, а також на підприємствах з виробництва пестицидів. Перекис водню також використовується для дехлорування води, що задіяна в технологічному процесі, з метою запобігання корозії або утворення хлорованих сполук при виробництві хлору.